QubesOS c'est un système pour accueillir des logiciels Windows ou Linux, de manière à les cloisonner du système et entre eux pour un meilleur contrôle et une sécurité accrue. Dans le principe, ça ressemble à un mélange entre logiciel de virtualisation et sandbox.
Je ne pense pas que ça existe en effet : d'une part chacun a ses préférences en matière d'outils et de paramètres, et d'autre part ce n'est pas dans la philosophie du libre de produire une suite de sécu opaque pour le débutant car fort équipée.
Mais normalement, sous Linux, tu devrais trouver ton bonheur : sur ce genre de système, les mises-à-jour applicatives sont faites au fil de l'eau et sont centralisées. Donc toutes les applications constituent en quelque sorte une suite logicielle personnalisable à la manière des plugins dans les navigateurs.